[devote]

<div></div><div></div><div></div><div></div><input />
<script>
    alert('сейчас пустых элементов всего: ' + document.querySelectorAll('body :empty').length);

    var emptyElements = document.querySelectorAll('body :empty');
    for(var i = emptyElements.length, elem; elem = emptyElements[--i];) {
        elem.parentNode && elem.parentNode.removeChild(elem);
    }

    alert('Осталось пустых элементов всего: ' + document.querySelectorAll('body :empty').length);
</script>