[BETEPAH]

BETEPAH,
не очень понимаю как. Напишите пожалуйста пример

Мне не с чего брать пример. Вы же не написали почему используете

document.write('<!--s_links--><!--check code--><!--/s_links-->');

вместо

<!--s_links--><!--check code--><!--/s_links-->

Поэтому я и предположил, что скриптом выводите, потому что есть какое-то if
Покажите это if и я попробую сделать обратное условие.

Пример: если у вас

if(isSapaEngine) document.write('<!--s_links--><!--check code--><!--/s_links-->');

тогда пишете в хтмл:

<div id="sapa"><!--s_links--><!--check code--><!--/s_links--></div>

и скриптом его очищаете

if(!isSapaEngine) document.getElementById("sapa").innerHTML = "";

Или я чего-то не понял? Для чего вам это вообще нужно - писать через document.write то, что можно написать без скрипта, просто в html?