[razorg1991]

Теперь даже поправил немного скрипт:

jQuery.noConflict();
jQuery(document).ready(function($){
 
        var $menu = $("#menu");
		var $logo = $("#logo");
 
        $(window).scroll(function(){
            if ( $(this).scrollTop() > $logo.height() ){
                $menu.addClass("navbar-fixed-top");
            } else if($(this).scrollTop() <= $logo.height()) {
                $menu.removeClass("navbar-fixed-top");
            }
        });//scroll
    });

А в html добавил еще диву с классом header-logo еще id logo. Теперь скрипт автоматом вычисляет, когда нужно фиксировать меню сверху ))))