попробуй такой вариант, вдруг прокатит:
function pmClick() {
alert(this.value_i);
}
for(var i=0; i < 2; i++){
placemark[i].value_i = i;
placemark[i].events.add('click', pmClick );
}
т.е. к каждой метке прикрепить значение i, потом в хендлере получить его как-то через this