[lord2kim]

YorikoSC, откуда взялись скобки?

{
        alert(x.charAt(i%2=0).toUpperCase());
        }

и естественно нужно обрабатывать (не)четность символов в отдельно цикле...

function Generate() {
	var random = Math.floor(Math.random() * 44)+1, x, final_str = "";
	
	document.getElementById("условие").innerHTML = random;
	document.getElementById("текст").innerHTML = "Введите текст длинной не менее чем "+random+" символов.";
	
	//alert(random);
	
	do {
		x = prompt("Введите текст длинной в сгенерированное число ("+random+")","");
	}
	while (x.length < random)
	
	for (i=0; i < x.length; i++) { // в цикле перебираем всю полученную строку и собираем новую на основе поставленной задачи
		if (i%2) { // если номер очередного символа строки делится на 2 с остатком - нечетный
			final_str += x.charAt(i).toUpperCase();
		} else { // иначе четный
			final_str += x.charAt(i).toLowerCase();
		}
	}
	
	alert(final_str);
}
Generate();