[danik.js]

Можно еще так сделать:
В файле объявляешь несколько функций:

var site = {
    initComments: function() {},
    initNews: function() {},
    initHomePage: function() {}
};

А в самой странице просто дергаешь нужную функцию.

Как можно замерить падение производительности при навешивании во внешнем файле?

Никак не можно. Она ничтожно мала, если только у тебя не тысячи элементов на странице. Лучше думай об оптимизации обработчиков скролла, анимациях и прочих вещах, действительно чувствительных к плохому коду.