Про автологин не понял. После регистрации придется либо перезагрузить страницу чтобы сервер по кукам ее провел, либо послать серверу ответ что куки-таки пришли, для чего прочесть-таки куки, убедиться что это оно и отгрузить. Сервер пометит у себя "зашОл"
Ну а чтобы куки пришли их надо отправить заголовками в процессе ответа, или тупо setcookie()