[Erolast]

Нужно выполнить какую-то функцию только после той функции, в которой она вызывается, а не непосредственно во время вызова, я правильно понял? Ну так это легко:

function myFunc()
{
   alert("Второй алерт");
}

function mainFunc()
{
  setTimeout(function(){myFunc()}, 0);
  alert("Первый алерт");
}

mainFunc();

Дело в том, что setTimeout никогда не выполняет функцию сразу. Он лишь планирует ее выполнение. Но интерпретатор JavaScript начнёт выполнять запланированные функции лишь после выполнения текущего скрипта