Если я правильно понимаю вашу проблему, то для ее решения достаточно перекрыть у тулбара стандартный конфиг
layout, которой отвечает за расположение элементов в контейнере.
Эта настройка есть и у тулбара, как у наследника абстракного контейнера, просто она по умолчанию 'hbox', а Вы можете установить свою, скажем 'column' и расположить элементы как душе угодно.