[Aetae]

Должно работать, примеры ваших ссылок в стдию.

<a href="http://site2.ru/foo?bar">site2</a>
<a href="http://site2.ru/foo?bar2">site2 2</a>
<script>alert([].join.call(
    document.querySelectorAll("a[href^='http://site2.ru']")
,'\n'))</script>