Нашел решение, сбрасывать координаты при закрытии
// обработка пункта меню личный кабинет
$('#cabinet-auth').click(function(eventObj) {
$('#auth-popup').offset({top:$('#cabinet-auth').offset().top+60, left:$('#cabinet-auth').offset().left-50}).show();
eventObj.preventDefault();
return false;
});
// закрытие всплывающего окна личный кабинет
$(document).click(function(e){
if ($(e.target).closest("#auth-popup").length) return;
$('#auth-popup').offset({top:0, left:0}).hide();
e.stopPropagation();
});