Я же говорю, jQuery не при чем, преобразование выполняет браузер. При изменении доктайпа документ не перестанет быть text/html контентом, сервер должет отдавать заголовок content-type: application/xml+xhtml, но это никто в здравом уме не использует.
Когда мы вставляем inline-svg в text/html контент с помощью innerHTML браузер выполняет преобразования и ничего с этим мы поделать не можем. В примере ниже атрибуты WIDTH и HEIGHT при вставке в документ без использования jQuery преобразуются в нижний регистр:
<!DOCTYPE html>
<html lang="en">
<head>
<title>…</title>
<meta charset="UTF-8">
</head>
<body>
<script>
var inlineSVG = '<svg WIDTH="300" HEIGHT="200"><polygon points="100,10 40,198 190,78 10,78 160,198" style="fill:lime;stroke:purple;stroke-width:5;fill-rule:evenodd;" /></svg>',
tmpContainer = document.createElement('div'),
svgElement;
tmpContainer.innerHTML = inlineSVG;
svgElement = document.body.appendChild(tmpContainer.firstChild);
tmpContainer = null;
alert([
svgElement.attributes[0].name,
svgElement.attributes[1].name
]);
</script>
</body>
</html>