[Aetae]

Обязательно спецсимвол перед строкой и после?
Просто так, не пойдёт?

html.replace(/([^#])(#[a-zа-я0-9ё_]+)/gi, '$1<a href="#">$2</a>');

P.S. А съедет у тебя потому что ты про третью скобку забыл,

$1<a href="#">$2</a>*!*$3*/!*