Сформулирую за ТС: будут ли работать скрипты динамически загружаемые в страницу методом innerHTML в какой-то там элемент в теле?
Ответ типа вот такого
http://www.javascriptkit.com/javatut...criptcss.shtml
Но явно там все старое, может теперь по-другому?