[bes]

по тому что setTimeout это функция
т.е. то что ты пишешь в скобках это параметры этой функции они вычисляются в момент вызова данной функции
вызов функции ни как не тормозит выполнения кода просто когда то в далеком будущем наступит событие timeout
и будет выполнен первый параметр функции setTimeout

я правильно понял, что ты утверждаешь, что первый параметр setTimeout, то есть func или code из цитаты ниже будет вычислен в момент вызова setTimeout?

но всё это рушится по описанию ниже
https://developer.mozilla.org/en-US/...ers.setTimeout

Calls a function or executes a code snippet after a specified delay.

var timeoutID = window.setTimeout(func, delay, [param1, param2, ...]); var timeoutID = window.setTimeout(code, delay);

и при простейшей проверке с регулировкой delay

А в чем тогда проблема setTimeout?

Замена alert на setTimeout(function() { }, 500) проблемы не решает.
Ошибок нет, ячейки не крашеные

должно решать, если ты сделаешь хотя бы так

setTimeout(function () {
	$('#my_table td:nth-child(28)').each(function () {
		if(this.innerHTML == '1') {
			$(this).closest("tr").addClass("active");
		}
	});
},*!*5000*/!*);

но сам понимаешь, какое качество кода получится: любая случайная задержка в ответе более N выставленных секунд и твой код перестанет работать

чтобы окончательно убедиться можешь добавить console.log и посмотреть перед сравнением какое значение в ячейке

$('#my_table td:nth-child(28)').each(function() {
            console.log(this.innerHTML);
            if(this.innerHTML=='1'){

а в целом, это элементарные действия по тестированию нерабочего кода (убрать лишнее, наалертить/наконсольлогить), поэтому прочти и это Зачем ТС должен сделать тестовый пример с возможностью запуска?
и надеюсь теперь ты понимаешь, насколько ущербен твой исходный пост