А вообще, эту хрень проще безо всякого prototype написать, он тут ни к чему, по-моему
<html>
<head>
<meta charset="windows-1251" />
</head>
<body>
<div class="class0"> <a href="">link</a> </div>
<div class="class0"></div>
<div class="class0"></div>
<script>
var $ = function (selector){
var o=Object.create($)
o.tags = document.querySelectorAll(selector);
return o
}
$.addClass = function(className){
for (var i = 0; i < this.tags.length; i++){
this.tags[i].classList.add(className);
}
return this;
}
$.copyHtml = function(){
var html=this.tags[0].innerHTML
for(var i = 1; i < this.tags.length; i++){
this.tags[i].innerHTML=html
}
}
$('div').addClass('class2').copyHtml();
</script>
</body>
</html>
но все зависит от юзкейса, конечно.