[Malleys]

array[i].sort(s);

array[i] - это элемент массива, не сам массив

var str = new String (prompt ("Input text"));
var array = new Array();
for (var i=0; i < str.length; i++) {
  array[i] = str.charCodeAt(i);
}

var sorted = array.sort(function(arg1 , arg2) {
  if (arg1 < arg2) return 1; 
  if (arg1 > arg2) return -1; 
  if (arg1 == arg2) return 0; 
});

alert(sorted);