Вобще херня какая-то. Надеюсь эта дикая фигня используется не в публичном сайте, а где нибудь без палева, для себя?
var data = [
["1", "Mike"],
["1", "Mike"],
["2", "John"],
["3", "Bob"],
["1", "Mike"],
["3", "Jim"]
];
var result = data.reduce(function(result, element) {
var key = element[0];
result[key] = result[key] || [];
result[key].push(element);
return result;
}, []);
console.log(result);