У меня так:
$.ajax({
type: "GET",
url: "edit.php",
data: 'id='+t,
success: function(json){
...
var arr_arr=json;
$(function() {
$( "#company" ).autocomplete({
source: arr_arr[0]
});
});
$(function() {
//alert (arr_arr[2]);
$( "#position" ).autocomplete({
source: arr_arr[1]
});
});
...
Не могу посмотреть Ваш пример, но у меня, вроде, работает. Возможно, можно сделать лучше, я не сильно опытен.