Это косяк вотчера WS, насколько мне известно, что у этой проблемы нет решения сейчас 
НО, ты же можешь использовать вместо WS:
1) Встроенный вотчер Snakeskin (--watch в CLI, натрави SS на папку с этим флагом);
2) Вотчер от Gulp или Grunt.
Там таких проблем нет.
	
	| 
		
			 Цитата: 
		
	 | 
	| 
		Может есть команда глобальной пересборки хотябы?
	 | 
	
Это можно, в настройках файл вотчера WS задай компиляцию не отдельного файла, а всей папки, где лежат твои шаблоны.
snakeskin myTpls/ -o '%filePath%.js'
Тут компилится папка, а результаты сохраняются рядышком с исходными файлами, подробнее 
https://github.com/kobezzza/Snakeski...0%BE%D0%B5-API