Если я правильно понял:
<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<meta charset="utf-8">
<title>JS Bin</title>
</head>
<body>
<button>Button</button>
<script>
var button = document.getElementsByTagName('button')[0];
button.addEventListener('click', function() {
window.open('http://ya.ru', '_blank');
this.setAttribute('disabled', 'true');
setTimeout(function() {
button.removeAttribute('disabled');
}, 5000);
});
</script>
</body>
</html>