Для простых случаев можно:
str="foo [url]http://example1.com/foo[/url] bar [url]http://www.example2.ru/search?q=foo&foo=bar[/url] baz"
console.log(
str.replace(/(http:\/\/[.\w/=&?]+)/gi, "<a href='$1'>$1</a>")
)
// foo <a href='http://example1.com/foo'>http://example1.com/foo</a> bar <a href='http://www.example2.ru/search?q=foo&foo=bar'>http://www.example2.ru/search?q=foo&foo=bar</a> baz
ЗЫ говнодвижок подставляет свое говно, уберите [url] из начальной строки