js_var = <?php $php_var;?>; - это не вывод РНР переменной в браузер,
а вывод будет либо используя котроткий php тег:
js_var = <?=$php_var;?>;
или, если он не разрешен (при старой версии РНР), то так:
js_var = <?php echo $php_var;?>;
Результирущюй HTML-код в отладчике смотрите (или просто исходный код страницы), должно быть значение у переменной.