мы делали в erwin концептуальную модель - а не шаляй валяй. ) Ну а запрос ваш, это же просто запрос к одной таблице для получения указанных полей и все, без всякой концепции, то бишь углубленной задачи.
Совет, хотя можете его и не воспринимать - не пишите в запросах имена полей и названия функций в одном регистре, плохо читается такой запрос. Лучше так:
$sql = 'SELECT id_indi AS id, nom name, prenom1 surname, ifnull(id_pere,0) id_fat, ifnull(id_mere,0) id_mot FROM got_'.$_REQUEST['ibase'].'_individu';
AS указан только раз, ибо уж не помню с какой версии его можно опускать.
А вот это - got_' . $_REQUEST['ibase'] . '_individu - не допустимо.
Нет времени сейчас, а выбор из таблицы дерева, это извечный вопрос, и о нем уже столько переписано. Есть такой подход:
NESTED SETS есть и иные. Могу добавить, по секрету, что можно вообще сформировать строку запроса, выполнить один запрос и получить дерево, и тоже без рекурсий. Только одно условие для этого нужно - ограничение максимального вложения какой либо величиной.