А почему не сделать это на сервере ?
Возможно что-то получится, если ток использовать FileReader
http://stackoverflow.com/questions/1...blob-to-base64
Прямой ввод в javascript-переменную обрежет неизвестные символы, вон у Вас пустые квадратики, наверняка с кодом 62