[Erolast]

имею ввиду без трансляции запускать на ноде) Есть такое? Мне модули, классы оч. нужны)

Вместе с babel устанавливается утилита babel-node, аналогичная по функционалу простому node, но транспилящая перед запуском, запускай ею:

//package.json
{
  dependencies: {
    "babel": "^5.0.0"
  },
  scripts: {
    "start": "babel-node ./index.js"
  }
}

$ npm run start

Второй вариант - использовать require hook (тогда можно запускать просто через node):

//index.js
require("babel/register");
require("./server");

Babel подменит глобальную функцию require своей собственной, которая перед запуском модулей будет их предварительно транспиллить.

В обоих случаях рекомендуется создать в корне проекта JSON-файл с именем .babelrc и заблокировать там фичи, которые уже поддерживаются используемой платформой.

Мой файл для io.js выглядит так (может, уже устарел):

{
    "blacklist": [
        "es6.classes",
        "es6.blockScoping",
        "es6.constants",
        "es6.forOf",
        "es6.templateLiterals",
        "es6.properties.computed",
        "es6.properties.shorthand",
        "regenerator"
    ]
}

как быть, если я хочу импортить модули в gulpfile.js?)

//package.json
{
  dependencies: {
    "babel": "^5.0.0",
    "gulp": "^3.0.0"
  },
  scripts: {
    "gulp": "gulp --require babel/register"
  }
}

$ npm run gulp <task> -- <flags>