[dfionov]

dfionov,
Загрузки фрейма дожидаетесь ? В ИЕ он типично дольше грузится, чем top document

Да, фрейм успевает загрузиться.
И забыл упомянуть - alert(win.Element) в том же IE8 срабатывает нормально, т. е. показывает ожидаемый

function Element() {
    [native code]
}

А вот в win.Object - undefined.

PS: просто alert(Object) выдаёт также нужный function Object()..., но мне нужно именно внутри iframe прототипы задать.