piast,
На видимой, но не активной вкладке типично замедляются все таймауты до секунды, рыть надо в сторону использования WEB Worker, процесс работает в фоновом режиме без ограничений по таймаутам, как на активной, так и на неактивной вкладке, исполнение яваскрипт на невидимых вкладках(поверх которых иная страница) браузера - приостанавливается. Тест активности/неактивности видимых вкладок удобно делать по:
document.visibilityState||document.webkitVisibilityState