[kos0760]

jQuery('.sp-megamenu-wrapper ul li a').click(function(){
    var sel = this.hash;
    jQuery('html, body').animate({
  	scrollTop: jQuery(sel).offset().top
        }, 900);
      return false;
   });

  var hash = document.location.hash;
  hash && jQuery('.sp-megamenu-wrapper ul li a[href *="'+hash+'"]').click();

Только сейчас понял в чем разница. Вы сделали плавное перемещение с другой страницы на якоря главной. Оно заметно, если блок с якорем близко к началу страницы.