[sortarray]

А не подскажете, почему если добавить в sort_arr имена которых нет в объекте materials, то команда log после сортировки materials считает что у объекта есть такие свойства со значением undefined?

из-за вот этой строки.
result[name]=object[name]

object[name], если его нет в object вычисляется в undefined

чтобы этого не было, можно сделать вот такой фикс

materials = {"Глина" : 10, "Цемент" : 5, "Вода" : 8, "Песок" : 14}
sort_arr =  ["Красители", "Песок", "Цемент", "Вода", "Примеси"]
   
sort = function(object, pattern){
  var result={}
  pattern.forEach(function(name){
    if(name in object) result[name]=object[name]
  })
  Object.keys(object).forEach(function(name){if(pattern.indexOf(name) === -1) result[name] = object[name]})
  return result
}
   
materials=sort(materials, sort_arr)
alert(JSON.stringify(materials))
  
for (n in materials){
    console.log(n+" "+materials[n])
      
    }