Вот пример с модальным окном и циклом...
<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<meta http-equiv='Content-Type' content='text/html; charset=windows-1251' />
<!--
<script src='http://code.jquery.com/jquery-latest.js'></script>
<script src="https://code.angularjs.org/1.3.9/angular.min.js"></script>
<script src="https://code.angularjs.org/1.3.9/angular-route.js"></script>
-->
<style type='text/css'>
</style>
<script type='text/javascript'>
window.onload=function(){
document.getElementById('info').innerHTML='Поток остановлен';
alert('Test');
document.getElementById('info').innerHTML='А так - фикушки';
for (var i=0; i<1000000000; i++) {};
document.getElementById('info').innerHTML='Все.';
};
</script>
</head>
<body>
<div id='info'></div>
</body>
</html>
Четко видно, что на время цикла никаких изменений на странице не видно.