[nerv_]

Предлагаете использовать libraryTarget: umd ?

ага. Отсюда вывод:
- или ты что-то делаешь не так
- или компилишь не правильно
- или вебпак глючит
- или тс глючит

У меня нормально работает:

<script src="http://nervgh.github.io/pages/recursive-iterator/dist/recursive-iterator.min.js"></script>
<script>
'use strict';
let root = {
    object: {
        number: 1
    },
    string: 'foo'
};

for(let item of new RecursiveIterator(root)) {
    console.log(item.path.join('.'), item.node);
}
</script>