[destus]

ради одной операции и на один раз не охота библиотеку подгружать

Тогда сравнивать

<script>	
		
		var newArr = ['P','P','Q','R'], oldArr = ['P','P', 'Q', 'p', 'Q','R', 'p'], arr=[];
		for (var i = 0; i < oldArr.length; i++)
		{
			var elem = oldArr[i];
			var index = newArr.indexOf(elem);
			if ( index != -1){
				newArr.splice(index,1);	
			}
			else { arr.push(elem); }			
		}
		document.write(arr);
		
   </script>