[laimas]

Получается, что мы из json получали текст и пытались его записать как массив.

Это уже ваши глюки, никто кроме вас не знает, что у вас есть data["All_Alarms"], и что с чем в конечном итоге вы сравниваете. Хотя черным по белому пишется - запишется содержимое строки из (data["All_Alarms"]).

А вот то что у вас некие данные "выпадают" из сравнения, это факт. У меня пример со случайной выборкой перемешиваемых данных и в нем это по теории вероятности когда будет более тех или иных совпадений, но если брать реальные записи как есть, то значит некоторые будут вообще отброшены. Хотя это я так предполагаю, а у вас может быть опять что-то никому неизвестное.