может использовать оператор
+= ?
for (var i=0;i<Arr.length; i=i+1)
{
var pc = document.getElementById("my_img");
if (Arr[i]=='a') pc.innerHTML+="<img src='img/1.png' alt='a'>";
else if (BlackArr[i]=='b') pc.innerHTML+="<img src='img/2.png' alt='b'>";
else if (BlackArr[i]=='c') pc.innerHTML+="<img src='img/3.png' alt='c'>";
else if (BlackArr[i]=='d') pc.innerHTML+="<img src='img/4.png' alt='d'>";
else if (BlackArr[i]=='e') pc.innerHTML+="<img src='img/5.png' alt='e'>";