nihaha,
Дык при таком задании массива объектов пустые вроде как вообще исключены из последущей сортировки ?
Можно наоборот, найти пустые и переставить сначало такие блоки в самый конец
var emptys = $("div.column").find("div.value:empty").parents("div.column");
(можно вообще при клике кнопок сортировки, - пустые сразу изъять(emptys = emptys.remove()) со страницы и вставить их в конец по окончании сортировки