Вот небольшой пример. Посмотри на комментарий в js
http://codepen.io/mogafk/pen/qaEVVV
т.е пример
var $a = $(".a");
$("#root").get(0).innerHTML += "<div class='b'>b-dynamic</div>";
var $b = $("div.b");
Так же имеет баг, потому что $a будет указывать на уже удаленные узлы..