[Опан]

Тогда после строки

var myfiles=["1.mp3","2.mp3","3.mp3","4.mp3","5.mp3"];

вставьте

var myusedtracks=[false,false,false,false,false];

а после 20 строки это:

audio.onended=function(){
	while(myusedtracks.indexOf(false)!=-1){
		var index=Math.floor(Math.random()*5);
		while(myusedtracks[index]==true){
			var index=Math.floor(Math.random()*5);
		};
		myusedtracks[index]=true;
		this.src="audio/"+myfiles[index];
		this.play();
	};
};