<html>
<head>
<script src="../jquery.js"></script>
<script>
//объект функций описывающий определяемые сервером задачи
var define = {
};
function AjaxLoad(){ // универсальная функция, обеспечивающая загрузку
….
}
</script>
</head>
<body>
<div>......</div>
<body/>
</html>
Какой смысл их подключать отдельным файлом. Хотя если скрипты объемные, то для удобства можно в режиме отладки иметь и отдельные подключаемые файлы, а вот на сервер помещать упакованные в один.