[ksa]

можно ли добиться эффекта плавного подчеркивания ссылок при наведении мыши на чистом JavaScript?

Скажу больше! Даже на чистом ЦСС.

<style type='text/css'>
a {
    line-height: 1;
    display: inline-block;
    text-decoration:none;
    cursor: pointer;
}
a:after {
    display: block;
    content: "";
    height: 2px;
    width: 0%;
    background-color: #000000;
    transition: width .3s ease-in-out;
}
a:hover:after,
a:focus:after {
    width: 100%;
}
</style>
<a href='#'>Test text</a>

Взято тут
http://dbmast.ru/plavnoe-podchyorkiv...-pri-navedenii