NeXan,
id="
li-comment-3502 ajax-new-comment"> это лишнее и что вы будите делать при создании следующего блока?
может класс? или хотя бы так
success: function (newComment) {
newComment = $('<ul class="children ajax-com">'+newComment+'</ul>');
//...
var top = newComment.offset().top;
$('body,html').animate({scrollTop: top}, 2000);
}