[ksa]

Должно вывести site.ru, site.com, site.info

Тогда, как вариант

var str='http://site.ru, [url]http://site.com[/url], [url]https://site.info[/url] sgdf, https://test.ru';
alert(str.match(/(https?:\/\/)(.+?)\.(.+?)(?=\s|,|$)/g));