<fieldset data-role="controlgroup" id="timer_t_ur">
<legend>Интервалы работы долива по таймеру</legend>
<div data-role="fieldcontain">
<label for="s_16463">(16463) Активация:</label>
<input type="checkbox" name="s_16463" onclick="writeCheckbox(this);" id="s_16463">
</div>
</fieldset>
<script src='https://code.jquery.com/jquery-latest.js'></script>
<script>
var checkboxRegisters = {c16463: true};
$("#s_16463").attr("checked", checkboxRegisters['c16463']);
</script>
Скрипт должен находиться в обработчике какого-то события, которое меняет checkboxRegisters['c16463']