Измените код так и посмотрите что произойдет:
$(document).ready (function(){
var myLink = $('a[href$=.PDF]');
console.log(myLink);
alert(myLink.text());
myLink.hide().text('моя ссылка').show(2000);
});
PS. Для форматирования вашего кода его можно заключить в специальные теги: js/css/html и т.п., например:
[js]
... ваш код...
[/js]
О том, как вставить в сообщение
исполняемый javascript и html-код, а также о дополнительных возможностях форматирования - читайте
http://javascript.ru/formatting.