[laimas]

while ($row = $query->fetch()) {
        echo "{$row->ID}";
        echo "{$row->Name}";
        echo "{$row->PrefixKod}";
        echo "{$row->FTPServer}";
        echo "{$row->FTPUser}";
        echo "{$row->FTPPassword}";
        echo "{$row->UpdOrgFTPPath}";
        echo "{$row->UpdOrgJurnalTemplate}";
        echo "{$row->UpdOrgUnicStr}";
        echo "{$row->UpdOrgSendMessageUser}";
        echo "{$row->UpdOrgTName}";
        echo "{$row->UpdOrgKodODU}";
        echo "{$row->UpdOrgKodKPO}";
        echo "{$row->UpdOrgFTPPort}";
  
    }

header('Content-Type: application/json');
exit(json_encode($query->fetchAll()));

На клиенте обходом в цикле получать каждое вставляя в соответствующее.