Предполагаю, что код, что вы представили корректно работает под ie.
<html>
<head>
<script src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/3.2.1/jquery.min.js"></script>
<script>
$(document).ready(function(){
var timer=0;
$("#flip").click(function(){
clearTimeout(timer);
$("#panel").slideDown("slow");
timer=setTimeout(function(){
$("#panel").slideUp("slow");
},2000);
});
});
</script>
<style>
#panel {
padding: 5px;
text-align: center;
background-color: #e5eecc;
border: solid 1px #c3c3c3;
}
#panel {
padding: 50px;
display: none;
}
</style>
</head>
<body>
<button id="flip">Click</button>
<div id="panel">Hello world!</div>
</body>
</html>