[Aetae]

Audaxviator, тогда уж так:

const mysql = require('mysql')

async function isRegistered(id){
  var r = await new Promise(resolve => con.query('SELECT * FROM `users` WHERE `userid`= ?', id, function(err, results) {
    if(err || !results.length) return resolve(false);
    return resolve(true);
  }));                                  
  return r
}


(async function(){
  //основной код тут  

  let r = await isRegistered(id);
  //...
}());

Только человеку не понимающему стути коллбэков это только вред принесёт.)