Стили можно добавить тем же скриптом
просто дописать в конец тега.
document.querySelector('style').innerHTML += '#col{background-color: red;}';
чтобы к вашем элементам не применялись стили сайтов используйте кастомные теги для ваших элементов.
Для чего вам нужна эта программа?