Batyabest,
а то что этот способ полная профанация, мысль не посещает?
Надо полагать, что
последовательность 5,2,3, это не прихоть, а номера вариантов ответов. А значит северу важно знать именно их. По уму, хотя я и не знаю что значат значения флажков, но сервер обязан знать, что 1, это 55, а 2, это 79. И ему от клиента эти значения не нужны, зная ключи этих значений он всегда сможет получить сами значения если надо.
Значит value флажков должны содержать значения ключей, а имена без индексов. Тогда значения массивов и будет порядком выбора.
Скрытым полем или как я предлагал, решайте сами. Но пользователю соблюсти последовательность и не видеть ее при этом (ведь варианты то он может менять) разве удобно? А вот если выбранные располагать согласно последовательности набора, это будет наглядно.