[Nexus]

var array='A,1,A,2,B,3,C,4'.replace(/\d+?/g,'').split(',').reduce(function(res,item,index,list){
	if(!!item && list.indexOf(item) === index)
		res.push(item,res.length/2+1);

	return res;
},[]);
alert(array.join(','));